心灵部队和克拉克总统的政府发现了埋藏在地球太阳系中的暗影飞船，并开始利用这些飞船的先进技术。克拉克政府的排外主义和极权主义日益盛行，并以军事事件为借口宣布戒严。这引发了火星的独立战争，而火星长期以来与地球的政治关系一直紧张。巴比伦5号也宣布脱离地球独立，其他几个地球联盟的外围殖民地也宣布独立。作为回应，地球联盟试图用武力夺回巴比伦5号，但在与空间站结盟对抗日益增长的暗影威胁的明巴利人的帮助下，这次进攻被击退。
本剧是一部描写现代家庭情感的电视剧，导演和主创人员皆为电视剧《红蜘蛛》的原班人马。每两集一个故事，通过对十个具有典型性的“问题家庭”的案例分析，向人们提出警示—该以怎样的态度面对家庭矛盾，以维持家庭的圆满，避免悲剧的发生，促进社会的安定团结。剧中通过十个家庭案件，揭示出个人内心的虚弱，描绘了人们由于情感错位引起的犯罪。导演将通过“情感十戒”向观众警示：每个人都应保持对生存的警戒，坚守生存规范。 该剧延续了《红蜘蛛》的纪实风格，并且加强了整体的艺术性。都晓介绍说，《家庭档案》不完全是纪实，但故事却力求真实，贴近老百姓的生活。为此，在演员的选择上剧组拒绝大腕加盟，选用一些实力很强的演员，除了史可、李婷、刘冠军等几位观众熟悉的演员外，大多数演员都是新面孔。
某日，索家坟路口发生一场自行车被撞、受害人无端失踪、肇事车辆逃逸的交通事故，随后事故科科长刘博率警员，在技术科长顾湘的协助下，对这起肇事案件进行了曲折离奇的追踪调查。受害人廖建斌逃逸并意外死亡使得追踪线索一度发生中断，事故目击证人哑女瞿木瞳的浮出水面，使得案情得以有所发展，按照她提供的重要线索，事故科警员一步步将怀疑的目光聚焦在了刑警队长唐国栋和他的白色桑塔纳上。缜密的取证和调查，是否能证明唐国栋的肇事嫌疑？还是现场另有其人？谎言千遍终成真理，还是真理却掩盖在谎言之中？真正的肇事者究竟是谁？
