这个星球上生活着不可思议的生物神奇宝贝。现在开始讲述少年小智和神奇宝贝们的相遇、冒险和战斗经历的故事。在结束了在成都地区的旅行后 小智只带上了他最先获得的神奇宝贝——皮卡丘 来到了芳缘地方。但是在到芳缘地方的途中，皮卡丘被火箭队的攻击变得异常奇怪...在AG中，小智和新加入的女主角——小遥，永远支持着小智的小刚，以及小遥的弟弟小胜，一起在芳缘地方，以及到对战开拓区旅行
全人类为之恐惧——。
在绿草甜美、宁静安和的青青草原，生活着一群无忧无虑的小白羊。聪明伶俐的喜羊羊（祖丽晴 配音）、美丽可爱的美羊羊（邓玉婷 配音）、懒惰贪吃的懒羊羊（梁颖 配音）、莽撞正义的沸羊羊（刘红韵 配音）、忠厚安静的暖羊羊（邓玉婷 配音），这群小家伙每天聚在一起，过着快乐的生活。而在森林另一端的黑色古堡里，住着邪恶狡猾的灰太狼（张琳 配音）和他暴戾无常的老婆红太狼（赵娜 配音）。灰太狼每天都要在老婆平底锅的敲打下前往羊村抓羊羊，羊村戒备森严，因此他想处种种办法，更发明许多奇形怪状的工具，然而最终总被机敏的小羊们挫败。 小羊和灰狼的战争就这样每天在青青草原上上演……
一对一起做实验的高中校友守着一个秘密：其中之一的Marshall发现了全世界最厉害的药物，是一种可以治愈几乎一切病痛的蘑菇。但是，要将它介绍给全世界是非常艰难的：美国缉毒局、大型制药公司和国际上的商人们都想阻止其面市。
私立碧阳学园的学生会，可以说集结了这个学校最美丽最聪明的女生。身材娇小、天马行空的樱野栗梦（本多真梨子 配音）经常突发奇想，召开各种讨论会，可是在军师兼毒舌的抖S红叶知弦（齐藤佑圭 配音）、超级热爱漫画的阳光女孩椎名深夏（富樫美铃 配音）、阴柔温顺的椎名真冬（堀中优希 配音）等成员的掺合下，会议内容经常歪倒天涯海角去。学生会的唯一男性副会长杉崎键（近藤隆 配音），暗藏着建立伟大后宫的梦想纵横捭阖，各路出击。而通过他之手，学生会有趣好玩的一面也被真是地记录下来。本片根据葵关南（作）、狗神煌（画）创作的轻小说改编。
