一心想成为幽灵猎人的天空寺尊于18岁生日时，收到来自十年前亡父生前所寄的幽灵眼魂（Ghost Eyecon）后，来自异世界的怪人——眼魔突如其来地出现在面前并盯上此物，甚至为救青梅竹马月村明里和御成而身亡。得到仙人的帮助之下而获得Ghost驱动器变身，成为假面骑士Ghost并得以九十九日短暂的生命复苏。为收集实现复活愿望的「15位伟人」眼魂，投身于影响世界命运的战斗中。
本季延续一辆专属于阳光森林幼儿园的人工智能校巴与小朋友们的故事。“小朋友的安全由我来守护”，每当小朋友们陷入麻烦，百变校巴都会变身消防车、警车、救护车、救援艇和飞机赶到现场出手相助。随着故事的发展，小朋友们也逐渐学会更多安全教育与情绪管理等知识。
仙界万年一遇的天才慕辰风，不到千年就修炼到 仙帝境，领悟到了道体源流后，拥有冲击更高境界的资格，却被三大仙帝围攻偷袭，最后逃脱一丝元神到蓝星落魄家族的私生子身上。“我说你们一群练武的，跟我一修仙的教什么劲？”“一代宗师，美式居合很牛么，看我万剑诀！”
