2012年日蚀的一天进行名为“魔宴（Shabbat）”仪式，从而诞生出魔物“魅影（Phantom）”肆虐。 本作主角操真晴人在此仪式中生还，如谜一般的白色魔法使把变身系统Wizard Driver交付给他并变身成为假面骑士Wizard。 从此踏入守护人类及与魔物战斗的命运。
在游戏与现实融合的世界中，主角林墨觉醒唯一性隐藏职业“神级BOSS召唤师”，拥有召唤BOSS级召唤物并共享其技能、神级投喂提升召唤物属性、“同甘共苦”让召唤物承受自身伤害等核心能力，后续还获得"神圣幻兽师"等进阶职业，通过不断刷副本升级、召唤各种强大召唤物，在职业认知冲突、资源争夺与势力对抗中成长，最终成为五星战将，完成个人使命并守护世界。
