2012年日蚀的一天进行名为“魔宴（Shabbat）”仪式，从而诞生出魔物“魅影（Phantom）”肆虐。 本作主角操真晴人在此仪式中生还，如谜一般的白色魔法使把变身系统Wizard Driver交付给他并变身成为假面骑士Wizard。 从此踏入守护人类及与魔物战斗的命运。
传说曾有一个古老而神秘的图腾领域，图腾代表着人类崇高的文明与美好的信仰，图腾兽更是用神奇的力量帮助人类，那时人与图腾兽共生，天下太平。但一场战争的爆发却将美好的生活毁于一旦。
