1942年，正在抗日战争焦灼之时，日军突袭新四军在北方地区的一处兵工厂，保卫兵工厂的独立团特务连浴血奋战，终因寡不敌众，阵地失守，连长孔圆被俘。孔圆的哥哥孔方是一名大学数学教授，精通数学逻辑分析，曾留学日本，对日军的情况有所了解。在新四军帮助下，孔方和未婚妻——心理学教授向海音混进日军占领区，里应外合，发动反攻，成功救出了弟弟和兵工厂人员并夺回了阵地。本剧取材于黄崖洞兵工厂保卫战以及众多兵工厂事迹，用普通人的事迹展现出一幅各阶层人民联合抗战的生动历史画卷。
健吾（竹野内豊饰）是个普通的水族馆员工，他原本有个幸福和睦的小家庭，最近却为了妹妹玛利亚（北乃きい饰）罹患重病而愁眉不展。除了要支付巨额的治疗费用，若不能早日找到匹配的肝脏，妹妹便有生命危险。健吾的未婚妻美奈子（板谷由夏饰）因无法承受巨大压力而离开了他。某日，健吾无意间救下一名欲轻生的女子，该女子名为梨沙（上戸彩饰），哥哥（稻垣吾郎饰）不务正业，拖欠高利贷巨款，梨沙只好去风尘场所工作为家里还贷，不堪重负的她已经丧失了对生活的信心。情急之下，健吾突然萌生和梨沙假结婚，再让她移植肝脏救妹妹的念头……
日本警视厅特殊部队（SIT）小队长濑文焚流（加濑亮 饰），在一次执行任务时遭遇队友的离奇死亡，面对高层他百口莫辩，最终被调职到公安部公安第五课——不明事件调查科。该部门专门调查一些匪夷所思的超自然案件，当然在所谓“科学昌明”的现代化社会，这也意味着第五课是一个很难得到认可的边缘部门。除濑文外，第五课只有油滑的上司野野村光太郎和智商高达201的怪女孩当麻纱绫（户田惠梨香 饰）。在此期间，预言师、神之手等各种各样拥有超能力（SPEC）的人物接连登场。濑文在和当麻办案的过程中，渐渐趋近了一个鲜为人知且充满阴谋和秘密的未知世界……
