海底小纵队是一群活跃在海底的小小冒险家。小纵队集结了皮医生（企鹅）、生物学家谢灵通（海獭）、摄像师达西西（腊肠狗）、机械工程师突突兔（兔子）、小队中尉呱唧（小猫）等7名伙伴，在核心成员巴克队长（北极熊）的带领下向着未知的海域不断探索前进。在本次电影的探险中，一座火山突然喷发，突然唤醒了太平洋海底的几百座火山组成的 “火焰之环”，这一突发性事件迅速演变成了一场全球范围的大灾难。即将集体爆发的火山群时刻威胁着被海啸冲上岸的角岛鲸、生活在火山群岛的帽带企鹅、小纵队维修站的设备、海洋农庄里植物鱼种下的粮食……更不用说那些常年居住在火山口的动植物们！海底小纵队的成员们必须在太平洋海域分头行动，分秒必争，全力救助那些生活在火山周围的奇异海洋生物们。
大猬（苏尚卿 配音）是一直勇敢快乐的小刺猬，虽然个性冲动莽撞的它常常惹出大大小小的麻烦，但大猬依然深受朋友们的信赖和喜爱。在一场意外之中，大猬竟然失去了记忆，于是，它和好友阿灰（汤水雨 配音）一起，踏上了寻找自我的旅途。途中，两人遇见了善良的人类小明（路知行 配音），善良的小明致力于动物保护工作，他屡屡帮助大猬摆脱困境，两人之间结下了深厚的友谊。阿玫（阎萌萌 配音）是刺猬谷首领的女儿，这场意外的旅途亦让它和大猬之间擦出了火花。邪恶而又贪婪的Thinkman博士利用了小明对动物的爱心，来实现自己的野心。大猬发现了博士的阴谋，它要如何才能够打败这个强大的敌人呢？
地下世界，千奇百怪，不仅生活着兵马俑，还有各种各样的青铜文物复活的青铜兽和一种叫做“地犼”的地底原生生物。 地犼与俑的战斗旷日持久，男主角蒙远是地下秦陵中一打杂的杂役俑，他和神秘少女史玉合作抓捕地犼、经历险境，不料却发现地犼与兵俑战斗不息的谜团，却因此遭遇更大危机......
倥偬半生的探险家黑眼镜因眼疾恶化，在中缅边境的木马鲁部落过起了半隐退的生活。好友解雨臣为治黑眼镜眼疾，带领病理学家老魏进入木马鲁丛林寻找罕见的寄生蜂以进行眼疾专利研究，不想队伍竟集体在丛林深处的山缝遇险。 得知消息的黑眼镜立即前往营救队伍，却发现山缝中竟盘踞着木马鲁人奉为“古神”的巨大怪物娜珈斯！队伍离奇受到“古神的召唤”，不得不继续深入古神巢穴。在经过一系列惊险的速降和攀爬后，他们终于抵达了一座规模宏大的南越地宫，不料地宫内不仅出现猛烈攻击人类的寄生虫，古神更是再次“召唤”众人开棺。他们在极限中艰难求生，也一步步揭开了古神的秘密……
连年亏损的民间马戏团被团长连人带物贱卖给奸商，其中宫兰兰和阿丽以及其他团员在新老板大金牙的忽悠下，一同登船开启了去泰国巡演的旅途。 行至东南亚热带雨林途中，突然遭遇了神秘巨蟒的袭击，他们搭救了一个名叫杰夫的神秘男子。可接连的巨蟒袭击造成船体沉没，杰夫提出带众人穿过雨林去找他的船，却不料这个男人的真实身份竟然是“偷猎者”。蒙在鼓里的马戏团等人就此踏上一条充满血腥的热带雨林之旅……
