遥远银河彼端，闪耀着一颗孕育魔法神力的星球——维尔哈伦。在至高天神的庇护下，这里的人民过着平静的生活。直到纪元3836年，一名神秘的黑衣人携着毁灭邪焰突然降临，却发现自己弄错了时间和地点，好在既定的命运一如他手中那本时之文书所记载……神力火焰失去掌控，到处肆虐，大祭司云轩为平定灾厄，决定在明鲸港召开“和平之祭”，选拔各国精英， 筹建灾厄特勤组，故事就从这里开始……
帕尔斯是一个富饶而又强大的国家，百姓们在此安居乐业，国泰民安。然而，异教徒之国鲁西达尼亚的铁蹄踏破了帕尔斯的宁静，纷飞的战火烧毁了辛苦维系的和平。帕尔斯在战场之上节节败退，丢掉了大片的疆土，国家走到了灭亡的边缘，王子亚尔斯兰（小林裕介 配音）亦不得不踏上逃亡的旅途，一路上保护着他的，是忠诚而又强壮的骑士达龙（细谷佳正 配音），两人相互扶持，是否能够完成复国的愿景呢？那尔撒斯（浪川大辅 配音）、耶拉姆（花江夏树 配音）、奇夫（大桥贤一郎 配音），一路上，亚尔斯兰结识了一群愿意跟着他出生入死的好友，他们相互信赖，相互依靠，彼此之间结下了深厚的友谊。在重重的困难之中，一行人艰难的向着王都进发。
第一集《谁毒害了大黄狗》 第二集《夜半呼救声》 第三集《警长遭窃》 第四集《紧急抢救》 第五集《抓不住的凶手》 第六集《假戏真做》 第七集《惨案发生以后》 第八集《森林饭店的灾难》 第九集《失踪的纽扣》 第十集《紧急行动》 第十一集《可怕的伐木声》 第十二集《外星人抢劫案》 注：第二部与第一部的黑猫警长造型不同。第二部警长脸部全黑，身穿红色警服。他的手下们也由第一部的白色制服改成黄色制服。
故事发生在一个名叫纳特拉的王国之中，王子维恩（齐藤壮马 配音）在父亲病倒之后，终于独自一人肩负起了治理整个国家的重任。纳特拉实在是太过于弱小了，每天都在遭受周边强国的霸凌和侵略，维恩既没有足够的钱来整顿内政，有没有足够的战力去侵略掠夺别国资源，慢慢的，国内的人才纷纷流落到了其他国家之中。而维恩最大的愿望，就是能够早日卖掉自己的国家，过上闲散的生活。
故事叙述阿空、阿静、阿能、阿震、阿风和杨一击等六位个性迥异的年青人，在曾受过军事训练的唐少校、柯娜和福伯带领和帮助下，互相融合、互相接纳、彼此学习，逐渐成长为拥有强大的爱心、超凡的意志及守护正义的能力的有为青年，组成了团结勇敢、战无不胜的“巨神战击队”。 六个年青人运用各种高科技神奇力量去对抗想要破坏并占领地球的邪恶势力，他们不断地迎接一次又一次挑战，不断地在战斗中学习成长，在历经无数次艰难险阻之后，最终在大家团结齐心的不懈努力之下，战胜了邪恶力量，保护了地球的和平。
