《康熙微服私访记3》沿袭前两部借古讽今、针贬时弊的新派古装轻喜剧作品风格，分为“锦袍记”、“食盒记”和“铃铛记”三个单元故事组成。“锦袍记”中康熙（张国立饰）派大太监三德子（赵亮饰）回故里调查贪官一事，然而当牵扯进亲情之后事情开始变得难以取舍；“食盒记”由宜妃（邓婕饰）的亲戚噶礼送的食盒引发；而在“铃铛记”中，康熙竟然独身离宫，当起了普通老百姓。
段大功和段大伟是一对才华出众的兄弟，但由于家境贫困，只能供养一个读大学。抓阄结果让哥哥大功如愿以偿，他顺利毕业成为一名服装设计师。而弟弟大伟为了帮助哥哥筹措学费，却不幸入狱。出狱后，大伟怀疑哥哥设局害他入狱，心怀怨恨，决定不回家而是独自闯荡。在监狱中，大伟结识了一位画家 死囚，并从中学会了绘画。然而，正当他打算展露头角时，却被一位老画家毕成阻挠，他误以为这是哥哥的阴谋，却不知这背后牵扯着老画家和死囚之间的复杂恩怨。 为了报复哥哥，同时也为了夺回失去的一切，大伟展开了与哥哥的斗争。即使大功让步退让，他也不肯罢休。他结识了哥哥的女友海烟，并对她展开了热烈的追求。大功选择了疏远海烟，默默离开，却不料大伟在每一次接近中无法克制地深深爱上了她。然而，海烟并不接受他，最终大伟在事业和爱情的低谷后，回到家乡。在那里，他意外得知自己并非母亲的亲生子。
