云飞雪的父亲云天罡与哥哥云飞山在八年前在护送龙脉的任务中惨遭暗算,云家血脉仅剩年幼的云飞雪,而云飞雪也被一股神秘的力量所寄生,那股力量竟与云飞雪合二为一,并幻化出一个与他一模一样的幻影,幻影寄生于云飞雪的意识之中,时刻准备着积蓄力量,吞噬掉他的神魂。刚刚压制住体内幻影的云飞雪收到父兄惨死的噩耗,心知若想为亲人报仇,重振云家,只有韬光养晦,隐藏实力。他明里游手好闲,背地里却聚集了一个名叫“暗影”的组织,暗中调查当年谜案。
大学生凌辰,参加学校的研究所实验,结果被冰冻了200年。200年后醒来,发现人类已经毁灭,废土上生活的全是人形化的动物少女。意外解除了凌辰冬眠的,正是一名奶牛少女——伊莉。为了活下去,凌辰发挥自己作为人类的科学文化知识,收集能力各异的兽娘们,扫清野蛮种族的威胁,建立一个末世理想国。