星星球机器人感染木马程序开始伤害人类，由于这种木马程序年代久远，只有过去的时空才能研发出来，于是开心超人回到过去的灵光星，寻找能清除木马程序的和平代码。但没想到的是，开心超人居然回到了和平代码还没有研发成功的时空，此时人类与机器人处于矛盾大爆发的时候……
「カードファイト！！ヴァンガード」 世界で数億人ものプレイヤーを数えるこのカードゲームは、 常に人々を熱狂させ、多くの絆を育んできた…… 孤独だった「新導クロノ」の運命は、未知のクラン《ギアクロニクル》を通じて ヴァンガードと出会ったことから大きく動き出した。 誇り高く、自身の可能性を追求する「綺場シオン」 ありのままの自分を認め、健やかに未来を描こうとする「安城トコハ」 彼らチーム・トライスリーは、自分たちの信じるヴァンガードを貫き、共に成長してきた。 そしてこの秋、 ヴァンガード普及協会が主催する超ビッグイベント、「Gクエスト」が開幕を迎える。 6つの支部クエストを制覇した者に与えられる栄誉、「ジェネレーションマスター」の称号とクランリーダーのチャンス。 新たな目標に燃えるトライスリーだが、その熱狂の裏では、 ヴァンガードを破滅へと導く巨大な陰謀が進行していてた…。 己が使命のため暗躍する伊吹コウジの「Plan-G」なる作戦とは？ 新たなる出会いを通じて、クロノたちはどんな未来を掴むのか！？ Gクエストに櫂トシキや雀ケ森レン、蒼龍レオンといったレジェンド級のファイターたちも参戦！ 新時代の戦いが今、始まる！
ブシロードのトレーディングカードゲーム「カードファイト!! ヴァンガード」を原作とするテレビアニメ・シリーズの第五期。第四期で一区切りを迎えた物語からは大半の登場人物が入れ替わり、主人公の新導クロノを中心とする新たな物語へと突入する。本作から梅本唯が新たに監督を務め、シリーズ構成は「ラストエグザイル -銀翼のファム-」「悪魔のリドル」の吉村清子にバトンタッチされた。キャラクターデザインは引き続き、とみながまりが担当している。 ある日、中学生の新導クロノは下駄箱に謎のカードの束と一枚の地図が置かれているのを発見する。それは“ヴァンガード”というカードゲームのものであり、“ギアクロニクル”と呼ばれる誰も見た事のない幻のカードだった。“ヴァンガード”の世界を知り、綺場シオンや安城トコハとの出会いを経て、クロノの運命は大きく動き始める。
自那之后已经过去了5年。Amazon几乎被驱除，世界趋于和平。但是被Amazon细胞感染的普通人Amazon化的现象在持续发生扩大，为此政府组成了新组织4C，秘密驱除Amazon化的人类。 其中，幼年时期被Amazon养大的少年·千翼变身假面骑士Amazon Neo与Amazon战斗。但在被生来的吃人冲动所驱使的他的面前出现的是，变身为乌鸦Amazon并作为生物兵器战斗的少女·优。对于这样的优，他第一次没有产生“想吃”的想，并被她吸引着。而优的真面目是被Amazon化的父亲杀死后，作为Sigma型而复活的Amazon。
漫画第16卷（2020年4月3日发售）的动画BD同捆版收录时长25分的OAD。
