有 230 万人口，其中八成人口为学生的「学园都市」，是比其他地区科技更为先进，并从事「超能力开发」的特殊地区。而整座学园都市中仅有七人的等级 5 超能力者之一御坂美琴，由于她的能力与个性使然，因而被卷入了学园都市中所发生的种种事件……
少年.结希安杰一直无法融入环境，心中怀有强烈的孤独感。他在自己变得无依无靠后离开故乡，来到了崇拜的音乐家活跃的城市原宿时，碰上了视觉系乐团“ECLIPSE”和“LOS†EDEN”的LIVE对决。活力四射的舞台表演令他震撼不已之时，安杰却突然感受到一股剧烈的痛楚——
