在充满未知的魔幻世界里，十二星座的超级能量分别落到了囧囧小学的十二个孩子身上。为了得到十二星座的超能力，来自囧囧星球的囧十二化身为各种角色，企图使用十二星座分辨法战胜这些孩子们。
得到了十二星座的能量后，这些孩子与星座性格变得越来越相符，他们既单纯又令人哭笑不得的处事方法闹出了囧 事一箩筐，但也用自己的智慧和团结破解了囧十二一次又一次的诡计。无论囧十二化身蟑螂、巨型二胎还是星座元神，看似强大的他十二星座少年面前变得不堪一击，被孩子们搞得一团糟。
为了帮助十二星座少年抵抗囧十二的威胁，唐僧三师徒、忍者神龟以及哈里波波等拥有强大法力的朋友们也加入到了战斗之中，他们或者在囧十二尚未谋划成功时就先发制人，或是在囧十二即将得手时突发冷箭，最后，囧十二不得不返回囧囧星球去求助大魔王授予他战胜十二星座少年的能力。
这些十二星座的孩子们在对抗囧十二的时候也不断遇到其他的事情，比如他们要应付令人头疼的考试，面对突然入侵学校的外星人，这些孩子们的做法或者天真烂漫，或者让老师和家长无言以对，总之他们令人哭笑不得的对话与行为总是让人捧腹大笑。
十二星座少年能否继续掌控星座能量？囧十二得到大魔王授予的能力后是否能够再次对抗孩子们？唐僧三师徒又找来了哪些帮手？我们会在《囧囧十二座》第二季中一一为你解答。
