碧落大陆上苏将军府的四小姐，一个修炼的废柴，人人得而虐之。唯独晋王南宫流云对苏落另眼相看，带她重回神殿，测定其为木火双系炼丹师，并且因为体内的龙之戒拥有几乎绝迹的空间能力。为开启空间能力，两人前往日落山脉屠龙，阴险的情敌李瑶瑶从中作梗，以身引魔兽骗取南宫的救助，又派人追杀苏落。苏落虽然得到小神龙，成功开启空间制服追杀者，但还是中了李瑶瑶的离间计，令南宫挡箭重伤，陷入灵魂紊乱的绝命境地。
宇宙流浪汉李约素无意中发现了多年前失踪的移民飞船“上佳”号，并目睹了令人惊惧的异常现象……人们逐渐发觉了正在逼近人类的巨大危险，几经周折最终科尼尔星域各方势力不得不合力应对强敌。孰料，异族的强大超乎想象，科尼尔星域人类在全军覆没之际，只得派出李约素向银河之心的强大人类文明求救……
在本季《超级飞侠12》中，超级飞侠依然会接收来自世界各地小朋友的电话，为小朋友定制他们需要的特别的东西，并将东西送到他们手上。当小朋友们遇到困难，乐迪会请求总部的帮助，超级飞侠将带来拥有各种属性的愿望能量球，和小朋友们一起摇身一变成为酷炫的愿望守护者，陪同小朋友一起解决问题。而上一季新登场的三位超级飞侠新成员：恐龙飞机超级飞侠大壮、速食卡车超级飞侠糯糯、高速火车超级飞侠咚咚，也会在这一季中展示他们的过人之处。而当困难升级，超级基地也会变成超级机器人，跟超级飞侠一起陪小朋友们度过难关。
