在 1995 年，艾丝拉发现了一张她在 20 世纪 40 年代拍摄的婴儿照片，于是决定回到 40 年代去寻找她的母亲和家人。尽管艾哈迈德警告她不要篡改时间，但艾丝拉和艾哈迈德还是来到了 1941 年。艾丝拉立即开始寻找母亲，而艾哈迈德意识到他们制造了时间裂缝。此外，哈立德发现了时间旅行，并从 1919 年来到 1941 年，一心想要寻找他对艾丝拉的爱。他的再次出现将会带来更多的混乱。
本剧讲述了在“机场占领事件”过去一年后，前刑警武藏三郎（樱井翔 饰）成为警视厅刑事部人质事件对策班（BCCT）搜查员，再次卷入前所未有的危机。东京都知事选举特别节目直播中，电视台突遭戴着妖怪面具、自称“妖”的武装集团占领，500名人质命悬一线，三郎的妻女也身陷其中。面对恐怖分子的威胁，三郎联手BCCT成员及警视厅新搭档，全力展开营救。随着“那个男人”的再度登场，一场暗藏巨大阴谋的极限战斗悬疑剧再度上演！
故事发生在抗日战争时期。因军统谍网连遭日特破坏，戴笠（王岗 饰）从集中营选出因故做牢的陈一鸣（庹宗华 饰）少校，令他组建“眼镜蛇”特工小组，暗杀日特驻华头子中村一郎（于震 饰），领命后陈一鸣即刻招募各路高人进行培训。这时，美军上校梅乐斯找到戴笠，要他设法营救被中村逮捕的美特工史密斯夫妇。中共高级特工黄天明（侯勇 饰）得到南京黄云睛（吴晓敏 饰）送来的情报，他奉上级指示，将史密斯夫妇所在位置故意泄露给军统南京站高站长，陈一鸣带着特工小组出发了。他们化装混入医院，先救出了史密斯夫妇，然后执行此次来的首要任务：刺杀中村一郎，他们能顺利完成任务吗……
退伍军人Nick Collins成为警队中的新人，他还不能完全适应「身份的变化」。《星际旅行》剧迷熟悉的著名老演员William Shatner将在首集中扮演因为醉酒驾驶而遭到逮捕的Henry McLeod。Andy的爱情生活仍然是本季的重要情节。
