随着科技的高速发展，意识沉浸式游戏《纪元》在全球大受欢迎，全意识接入的游戏体验和有自主思维的NPC让玩家仿佛置身一个“真实的玄幻世界”。以游戏代练作为生计的施嘉杰和肖雷两人，意外的收到了《纪元》游戏的进入器。为了游戏中大赛的巨额奖金，施嘉杰决定进入游戏一试。殊不知，却卷入了莫名的追杀中，而这却只是拉开了这层层阴谋的序幕……
明治维新时期，敌我双方为了各自的理想和目标而奋勇厮杀。在此期间，名人志士不断涌现：大久保利通、木户孝允、坂本龙马、冲田总司。维新一派为了推动新时代的到来，不惜采取暗杀的手段，而绯村剑心正是众多刺客的中的一员。孤儿出身的绯村师从比古清十郎学习飞天御剑流剑法，年轻气盛的下山参战，在奇兵队中崭露头角。凭借一身的本领，绯村最终成为令幕府一派闻风丧胆的刽子手拔刀斋，同时他也和宿敌壬生狼斋藤一有过无数次对决。明治政府建立后，绯村收起屠刀，成为一名腰挂逆刃刀的浪人。在流浪途中，他结识了神谷道场的继承人阿薰、东京府士族后代明神弥彦以及原赤报队成员相乐左之助。在一次次的战斗中，他们的友情不断加深，绯村那颗满是血污的心灵也慢慢得到净化……本片根据同名漫画改编。
