影视公司宣传企划杨佳（刘诗诗 饰）得了怪病，命悬一线。暗恋她的程序员刘同（胡夏 饰）为使她不留遗憾，决定在她每次昏迷苏醒之际，以穿越之名为她圆梦。但，刘同的行动并不顺利，除了突发情况带来的穿帮，还有来自情敌尹哲（大左 饰）的奋力阻挠、戳穿。刘同竭尽全力与重重困难斗智斗勇，结果却完全出人意料——原来，杨佳并非真病，她是为对付上司骚扰，佯作患疾。刘同的努力，她完全明了，刘同为她精心设计的从民国到未来，跨越200年的美妙梦境，让杨佳深受感动。大家到此方才恍然大悟。可是，又一个意外横飞而来……
神秘的沙尼达尔之花，在美丽女性的胸口恣意绽放。将花朵取下并提取有效养分之后，可以制成效果极其明显的特效药。一家名为“沙尼达尔”的机构随之建立，该机构从全国各地网罗来那些为数极少的可以培育沙尼达尔之花的女性，为她们提供了高达一亿日元的报酬以及周到舒适的生活环境。治疗专家美月响子（黑木华 饰）与植物学家大泷贤治（绫野刚 饰）在该机构邂逅，在与田村友里惠（伊藤步 饰）、美本美树（山下莉奥 饰）、立花遥（刈谷友衣子 饰）等女性的接触过程中，他们渐渐了解到沙尼达尔之花的危险之处，而两人之间某种感情也悄然萌生。
该剧以明代武林为背景，以暗器为线索，讲述了冷兵器向热兵器的过渡。 身为名门正派的仲裁堂出了两个“异类”，一个是仲裁熊云铮（栾浚威饰演），一个是仲查叶藏飞（赵鸿飞饰演），两人虽出身不同却“物以类聚”亲如兄弟，受满口宣扬武林正统的同道中人所排斥，熊云铮在五年前断一宗暗器案之后竟深深迷恋上暗器，认为暗器也应归为武林正统，直至从秘密渠道搞到火枪，痴迷于此，后被同门设计暗算死于火枪之下，叶藏飞终将凶手捉拿凶器查明，为兄弟报仇并一心想恢复武林秩序，对火器甚是排斥，但最终也无奈命丧火器之下。谁也无法阻止时代的进步，《暗器》带你见证中国兵器的进化史。
