《幼女战记剧场版》制作决定！统一历1923年6月。 金发碧眼的幼女，谭雅·提古雷查夫，正作为部队勤务的一环而在北方军管区诺登战区第三巡逻线进行帝国军士官学校最终课程的研修。 作为航空魔导师向着光辉履历踏出第一步的研修，平安无事地结束——本该如此。 但事态却向着超出预料的方向转变。 以协约联合的越境侵犯为契机，帝国与协约联合进入战争状态。 随着转移至战时体制，谭雅被交付了观测任务，但协约联合军发动奇袭，谭雅陷入不得不与敌军魔导师中队单独交战的事态。 敌众我寡，就连在我军抵达之前牵制敌军都无法做到，但逃跑的话则难免敌前逃亡的死罪，她面临这种绝望的状况。 为了无论如何存活下去，并在面对高层时做到最好的应对，谭雅使用了某个战略……。
单纯善良的北白川玉子（洲崎绫 配音）、外刚内柔的常盘绿（金子有希 配音）、我行我素的牧野神奈（长妻树里 配音）和外冷内热的朝雾史织（山下百合惠 配音），四位好友相互陪伴，度过了人生中最快乐的三个年头，如今，毕业季在即，面对尚且处于迷雾之中的未来，四个女孩心中有着隐隐的不安，但更多的，还是对日后生活的希冀和幻想。玉子家中世代经营着一间打糕店，而玉子又是家中的长女，这让玉子不得不开始考虑起了继承家业的想法。与此同时，玉子的青梅竹马大路饼藏（田丸笃志 配音）亦有着自己的选择，尽管他家和玉子家是商店街的竞争对手，但他俨然已经喜欢上了可爱的玉子。
