机动战士高达SEED的系列作再开。这次除了我们大家熟悉的基拉（保志总一朗 配音）、阿斯兰（石田彰 配音）等人外，还有大量新角色的登场。而故事也将演变的更为复杂，冲突加剧，战争升级。 C.E.70年2月，“血染情人节”事件的辐射效应还在地球联合军和ZAFT中延续着。二者发动了数次对抗，伤及众多无辜百姓。C.E.71年6月，地球联合军居然不顾条约发动了对中立国家奥布联合酋长国的侵略。这让少年真飞鸟（铃村健一 配音）在一瞬间失去了自己全部的亲人，而且都是在自己眼前。这件事对飞鸟的打击不小，让他这个无忧无虑的平凡少年，决定加入ZAFT。加入ZAFT，飞鸟遇到了许多挫折和坎坷，也看到了人性的残忍和无奈，最严峻的情况是自己内心始终笼罩着家人离去的阴影。飞鸟的成长在ZAFT正式开始。他和基拉、阿斯兰他们又会有怎样的交集呢？
高度发展的都市，拉塞尔市。 在讴歌繁荣的这座城市中，动摇这个世界的巨大阴谋开始启动—— 立刻察知阴谋动向的男人索德，为了揭露阴谋而投身于不为人知的战斗当中。但他得到的线索却只有“El Dorado”这样的关键字而已。在战斗当中，索德遇到了一位名叫索菲亚的少女。索菲亚也在寻求着失踪的哥哥皇后留下的讯息“El Dorado”的含义。索菲亚失去了皇后，而索德也有过失去妹妹的过去。被“El Dorado”这一字句所吸引的两人，从对方身上感受到看不见的羁绊，并开始一同行动。 就这样，各自的心意交错的旅程开始了——
小时候看过夏依妮·莎莉温的魔法表演后，梦想成为魔女的阿科，进入了与莎莉温相同的传统魔女育成名门校“露娜诺娃魔法学校”。
嘉味田正一（田丸笃志 配音）是一个极为平凡的高中二年级男生，有着一本正经的外表，却常常会陷入脑洞大开的幻想之中。在填完志愿调查表后，正一忽然察觉到自己已经站在了人生的分叉路口前，对未来产生了无限的希冀和稍许的不安。乐观开朗的班级偶像常木耀（佐仓绫音 配音）、正一的青梅竹马桃乃今日子（木村珠莉 配音）、态度强硬内心却十分温柔的桧山水羽（井泽诗织 配音）、柔弱内向缺乏自信的上崎真诗（三上枝织 配音）、身手矫健的足球健将宫前透（下地紫野 配音），在青春的最后时光里，正一会和这些性格迥异的女孩子们发生怎样的故事呢？
故事发生在一个名为帕帕拉宿的奇幻国度之中，六年级的女孩梦川唯（伊达朱里纱 配音）一直渴望着能够成为一名偶像，然而，成为偶像对于一个平凡的女孩子来说是一件多么可望而不可及的事情啊，虽然所有人都质疑梦川唯的梦想，但她始终坚信，只要不断的努力，总有一天可以将梦想实现。 某日，帕帕拉宿竟然开张了偶像主题公园美妙天堂，传闻中超级偶像真中啦啦（茜屋日海夏 配音）也要前来助阵。个性活泼开朗，非常擅长运动的虹色妮诺（大地叶 配音）、风格酷炫特立独行的学姐幸多美知留（山田唯菜 配音）、嗜钱如命的华园秀香（朝日奈丸佳 配音），霎时间，一大批可爱的偶像涌现了出来。
