故事开始于本叔叔去世之后：高智商少年彼得·帕克在跟随学校参观Oscorp公司时被一只逃出实验室的辐射蜘蛛所咬，并获得了不可思议的能力。当然，随着强大的能力而来的还有巨大的责任——从此高中生彼得成为了“蜘蛛侠”，不一样的人生就此展开！
东京都高度育成高中，是以升学率、就业率100%为荣，每月支付相当于10万日元金钱的梦想学校。但是，其内在是只有一部分成绩优秀者才能得到好待遇的实力至上主义学校。迎来第3学期，从D班晋升为C班的绫小路等人前往林间学校。在那里实施的是被称为“混合集训”的全年级联合进行的特别考试。就像它的名字一样，按男女分开，必须结成由多个班级人员混合的小组，以该小组为单位进行评分的考试。如果不与一直以来作为敌人而竞争的其他班级的学生们合作，就无法获得高分，而且最重要的是，在没有达到分数线的小组中将有人退学。动荡的第3学期即将拉开帷幕！
