《国旗阿妈》讲述的是某眼科医院由组长华静芳（王姬饰）、主任夏光（周野芒饰）等一行多人组成的医疗小组入藏进行白内障医治工作的故事。藏族老人次仁曲珍的事迹让医疗队成员无比敬佩，这位老人在自己家的院落中每天升国旗，四十五年从未间断，被称作是“国旗阿妈”。医疗小组的成员为了能给老阿妈做手术遭遇了种种挫折和意外，最终齐心协力，使阿妈重见光明，在这个过程中，医疗小组的成员们都经历了一次精神洗礼。
轮椅上的乔纳森一直由保姆贝兹照顾,贝兹突然心脏病发,一直疏于照顾弟弟的哥哥克里斯托弗亲自照顾弟弟.兄弟两人多年隔阂,相处并不融洽.妮娜是克里斯托弗唱片公司的新职员,恰巧刚搬到乔纳森家旁成为了邻居.乔纳森对妮娜一见钟情,公司内,克里斯托弗也对妮娜大献殷勤.歌手罗宾因对歌词不满,唱片迟迟未能推出,乔纳森无意间听到罗宾的曲子,为其添词.克里斯托弗将歌词拿到公司,公司震惊,但大家都以为歌词为克里斯托弗所写.妮娜也被歌词所感动,接受了克里斯托弗.乔纳森知道自己的歌词被人误会为克里斯托弗所写,并知道妮娜与克里斯托弗走在了一起,倍受打击.最终妮娜知道了真相,勇敢的表达了内心的真实情感.
